中國新版電子護照內頁有中國各地風景照和中國地圖，因在南海、藏南等版圖上的爭議，引起越南、菲律賓、印度等周邊國家“反彈”，在入境時對持新版護照的中國公民發放另紙簽證，或要求額外報備，但并未影響正常入境。

因中國新版護照印有中國南海“九段線”，越南首都河內國際機場入境處、北部涼山邊境人員等，拒絕在其上蓋章，而向中國入境者發放“另紙簽證”。中國公民仍可持此護照正常入境。

據菲律賓外交部網站28日消息顯示，菲方也將效仿越南的做法，拒絕在中國新版護照上蓋印簽證，而在另外的簽證申請表單上蓋章，以此避免通過蓋章承認中國在南海劃定的“九段線”。

記者從中國駐越南、菲律賓、印度使館了解到，目前暫未接到中國公民因新版護照被拒絕入境的反饋。

美國國務院發言人紐蘭近日表示，美國仍然認為中國的新版護照是合法文件，入境口岸官員會在這個版本的中國護照上蓋章，但這“不代表認可中國的主張”，望各當事國協商化解爭議。

外交部發言人洪磊也在例行記者會上呼吁，相關各方不要過度解讀中國新護照中的地圖，中國會繼續同相關各方保持溝通，促進中外人員交流的健康發展。