在羅家倫之后，清華經(jīng)歷了一年多沒有校長的“真空時期”，說它“真空”，并非說它真的沒有校長，而是后來的兩位校長都不被清華師生所接受，先后被驅(qū)走，這一年多管理學(xué)校的，實際上就是教授會(及教授會所產(chǎn)生的評議會和校務(wù)委員會)，直到1931年梅貽琦校長到任。

接替羅家倫當(dāng)清華校長的，是喬萬選。他是由正占領(lǐng)北平的閻錫山派來的。說起喬萬選，其實也是個出身正路的學(xué)者，他是清華1923年畢業(yè)生，美國哥倫比亞大學(xué)法學(xué)博士，回國后任過東吳大學(xué)法學(xué)院教授、中央大學(xué)法學(xué)院副教授等職。當(dāng)然，他與閻錫山的關(guān)系也非同一般，不但是閻的老鄉(xiāng)，而且也是他的幕僚。

清華大學(xué)的教授們不喜歡喬萬選并非是出于對他個人的什么好惡，而是對政治勢力干涉校務(wù)一向反感。1930年6月25日，喬萬選前來上任，竟是帶了閻錫山軍隊數(shù)車的士兵前來壓陣。而清華的學(xué)生們毫不示弱，打起“拒絕喬萬選”的大旗，在校門口組織糾察隊阻止喬萬選進(jìn)校。喬萬選最終知難而退。

事后，清華校務(wù)委員會致電閻錫山：學(xué)生純出于愛校熱忱，其心無他，而目前校務(wù)已由校務(wù)委員會維持，不受影響。兩天后，清華教授會也發(fā)布宣言表態(tài)：一、“校長自應(yīng)由正式政府主持教育之機(jī)關(guān)產(chǎn)生，若任何機(jī)關(guān)皆可以一紙命令，任用校長，則學(xué)校前途，將不堪設(shè)想。二、愿學(xué)校行政，亦能走出政潮，獨立進(jìn)行，俾在兵戈擾攘之中，青年尚有一安心求學(xué)之處。”

閻錫山再也沒敢選派新校長前來清華。

又過了9個月，此時中原大戰(zhàn)已經(jīng)結(jié)束半年，蔣介石掌握的國民政府又控制了北平。清華校長的人選問題又?jǐn)[在面前。

這一次，親自兼任國民政府教育部長的蔣介石選中國民黨中央政治學(xué)校副主任吳南軒來做清華校長。吳南軒，復(fù)旦大學(xué)畢業(yè)后，留美10年，回國后擔(dān)任過河南大學(xué)校長等職，也算是學(xué)人出身。

但是在清華教授們的眼中，吳南軒并無學(xué)術(shù)地位，加上他與國民黨政府的關(guān)系，教授們對他并無好感。4月，吳南軒進(jìn)校后，他公開宣布他的使命是“為黨國培養(yǎng)人才”，專斷獨行，反對教授治校的制度，很快就與教授會產(chǎn)生尖銳分歧。

5月28日，教授會根據(jù)薩本棟、金岳霖、楊武之等15位教授的聯(lián)名要求，召開臨時會議，通過決議，譴責(zé)吳南軒“惟務(wù)大權(quán)獨攬，不圖發(fā)展學(xué)術(shù)，加以蔑視教授人格，視教授如雇員”，要求教育部“請另簡賢能”。第二天，清華學(xué)生會也召開全體學(xué)生大會，表示堅定支持教授會決議。學(xué)生們還整隊至校長住宅，請其即時離校。

在清華的一片反對聲中，吳南軒帶了清華的印信，逃到了市區(qū)的東交民巷“遙控辦公”，但最終還是沒有撐過去，在6月25日離開了北平。

這之后，南京的國民政府也不敢隨便派人擔(dān)任清華校長。

吳南軒走后，南京教育部曾委派翁文灝“暫代校務(wù)”，翁以兼職太多一再推辭，教育部又轉(zhuǎn)派理學(xué)院院長葉企孫處理校務(wù)。在葉企孫按學(xué)校規(guī)定學(xué)術(shù)休假去德國后，清華教授會就向南京教育部索取了選舉代理院長、代理教務(wù)長、秘書長的臨時權(quán)力，在很罕見的沒有校長的一年多時間里，清華大學(xué)的教授治校體制就這樣合法化并固定下來。